2035. Deux ans après avoir sauvé le métro de la menace des Noirs, Artyom est retourné vivre à la station VDNKh. C’est un héros brisé, obsédé par l’idée que l'avenir de l’humanité se trouve à la surface, et non pas dans les sombres couloirs du métro où elle semble régresser un peu plus chaque jour. Tenu pour fou, Artyom s'accroche désespérément à un souvenir, celui de la voix qu'il a entendue sur une radio militaire, quand il était au sommet de la tour Ostankino avec les Stalkers. Aussi, depuis son retour, remonte-t-il quotidiennement à la surface, malgré les risques, pour tenter d'entrer en contact avec d'autres survivants.Le temps passe, et Artyom sombre peu à peu dans la dépression jusqu'à l'arrivée d'Homère à VDNKh : le vieil homme qui n’a de cesse de vouloir écrire son Histoire du métro, prétend en effet que des contacts radio ont déjà été établis avec d'autres enclaves..